撰文丨nagashi 编辑丨王多鱼 排版丨水成文
自1979年被发现以来,p53基因一直是肿瘤学研究的焦点之一。在Pubmed数据库中用p53为关键词搜索,可以找到超过十万篇文献。
在Nature杂志2017年的一项统计中,p53基因以绝对优势位列过去几十年最热门研究基因榜第一名。 在多种肿瘤中,p53是一个拥有广泛而强大功能的抑癌基因,被誉为“基因组守护者”。p53会响应细胞中的各种应激源(例如DNA损伤)而被激活。p53的激活会促进DNA修复,或促进异常的细胞受控死亡,从而阻止癌症的发生和发展。因此,p53基因突变在许多癌症中非常常见,超过一半的癌症患者携带了p53基因突变。p53基因的突变是癌症发生、发展、治疗耐药性和预后不良的重要驱动力。 然而,长期以来,一个备受争议的问题是,p53对基因组的守护作用对于预防癌症是否重要?
虽然p53基因突变很可能导致癌症,但癌症的隐患具体发生于p53基因突变之前还是之后,仍未可知。p53与癌症之间,成了一个“先有鸡还是先有蛋”的问题。 2022年8月17日,纪念斯隆凯特琳癌症研究所的研究人员在国际顶尖学术期刊 Nature 上发表了题为:Ordered and deterministic cancer genome evolution after p53 loss 的研究论文。 该研究表明,当细胞缺失p53后,并不是单纯地引起基因混乱,而是促进一种可预测的、有序而确定的癌症基因组进化。这种出人意料的发现提供了一种新的方式来思考治疗癌症的可能性。
长期以来,科学家们一直在努力全面了解p53在癌症中的作用,尤其是它对基因组的影响,部分原因是目前很少有好的实验室模型能够在肿瘤发展的最早 (良性) 阶段,即细胞获得明显癌变特性之前研究p53的功能。
该论文的第一作者 Timour Baslan 博士表示, 绝大多数癌症基因组研究都是基于对人类肿瘤的分析,而很少在肿瘤发生前后就对其进行研究,这意味着我们不可能在肿瘤早期阶段了解p53缺失是如何导致癌症的。 为了认知这些早期癌变现象,研究团队创造了一种特殊的胰腺癌小鼠模型,在这种模型中,p53突变状态可以被检测到,而与肿瘤的发展无关,因此可以测量早期癌细胞从良性转变为恶性状态时的基因变化。
在小胰腺癌小鼠模型中,散发性p53失活后的早期癌细胞的谱系追踪
该模型的关键特征是一组荧光标记,可以记录特定的遗传事件,并可以用显微镜检测。其中一个标签是红色的,记录了KRAS基因突变的存在,已知KRAS基因与促进人类和小鼠的胰腺癌有关。另一个标签是绿色的,记录着p53的丢失。KRAS突变但p53正常的细胞发出红色和绿色荧光,而p53缺失的细胞只发出红色荧光。 这种视觉效果让科学家们能够在小鼠体内识别出失去p53功能但仍远未成为完全癌症的特定细胞群。通过收集这些特定的细胞,然后对它们进行单细胞DNA测序,就能够识别出p53缺失后立即发生和持续发生的基因变化。
单细胞DNA测序分析显示p53缺失后立即发生和持续发生的基因变化
令人惊讶的是,研究观察到的变化似乎总是以一种一致的模式发生:首先,细胞缺失了染色体的特定区域;然后,在大量染色体缺失之后,基因组发生加倍;最后,随着基因组加倍,细胞继续获得进一步的缺失,但也独特地获得了特定基因的额外拷贝——称为增益和扩增。
p53缺失后引发的基因变化总是以一种一致的模式发生
这意味着,p53基因突变常常被认为导致基因组混乱而致癌,但这项最新研究结果表明,p53缺失本身不足以导致癌症,相反,缺乏p53的细胞必须以有序的方式获得额外的基因变化,最终才会失控并发展为癌症。
癌症基因组进化的不同和有序的阶段伴随着良性到恶性的转换
更重要的是,这些新的发现增进了人类对肿瘤基因组进化“规律”的理解,或将推动新的癌症治疗方法的出现。 目前,许多抗癌药物以肿瘤中的基因扩增为靶点,由于这些基因扩增是在肿瘤发生之后期获得的,因此一种抗癌药物往往只能作用于少数几种甚至只有一种肿瘤类型。这意味着针对这些基因扩增的药物可能只杀死某些癌细胞,而不伤害其他癌细胞。
全基因组、靶向捕获和单细胞测序证实了人类疾病的进化原理
因此,如果能针对癌症发展早期的基因缺失开发相应的药物,也许就能获得一种广谱性的抗肿瘤药物,为广大癌症患者带来新的希望。
Scott Lowe教授
参考资料 : https://www.nature.com/articles/s41586-022-05082-5 https://www.mskcc.org/news/scientists-solve-30-year-old-mystery-about-p53-protein-dubbed-guardian-genome
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