注册 | 登录 | 充值

浙江大学:机器学习促进药物研发领域的新技术进展

资助成果

2022-08-29   来源 : 浙江省自然科学基金委员会

1662 0

近期,浙江大学药学院和智能创新药物研究院朱峰教授团队与阿里巴巴-浙江大学未来数字医疗联合研究中心合作在《Nature Protocols》发表了题为“Optimization of metabolomic data processing using NOREVA”论文。该论文报道了一套基于机器学习和并行计算的优化组学信号处理策略的方法,通过大规模扫描现有的海量信号处理流程,针对用户给定的代谢组学原始数据,可以快速地优化出性能最佳的组学数据处理流程。这一方法实现了对新药开发领域常见的“时间序列”和“多分类”代谢组学问题的数据处理,对药物靶标发现、药物代谢、药物响应与疾病发生发展的病理学机制研究有着重要的价值。本研究得到浙江省自然科学基金杰出青年项目等资助。

 99.png

代谢组学是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有代谢产物同时进行定性和定量分析的一门学科,被广泛用于揭示小分子与生理病理效应间的关系。由于其具有最接近表型的独特优势,因而与新药研发领域科研工作者的目标高度契合。目前,代谢组学已经被应用于药物开发的各个阶段,包括药物靶标识别、先导化合物发现、药物代谢分析、药物响应和耐药研究等。基于代谢组学的高性价比特性,它被研究者给予了厚望,有望显著加速新药开发的进程。然而,代谢组学领域还面临着严重的信号处理与数据分析问题,对其应用构成了巨大挑战。为了有效消除由环境、仪器和生物因素所引入的不良信号波动,需要开发针对代谢组学信号处理开展系统优化的新方法,为不同组学研究量身定制最优的数据分析策略。

 100.png

为解决大规模扫描海量信号处理流程过程中所面临的计算资源瓶颈问题,本研究首次将并行计算架构引入代谢组学数据处理。该项工作中的测试显示,相比串行运算来说,该方法整合的并行计算仅在个人电脑上就将运行效率提高了10倍以上,目前正在推进在阿里云平台上部署运行和对外服务。

浙江大学药学院博士研究生傅建波和张滢为该文的共同第一作者,浙江大学药学院和智能创新药物研究院朱峰教授为通讯作者。


版权声明:本网站所有注明来源“医微客”的文字、图片和音视频资料,版权均属于医微客所有,非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明来源:”医微客”。本网所有转载文章系出于传递更多信息之目的,且明确注明来源和作者,转载仅作观点分享,版权归原作者所有。不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。 本站拥有对此声明的最终解释权。




发表评论

注册或登后即可发表评论

登录注册

全部评论(0)

没有更多评论了哦~

科研资讯 更多>>
  • 肿瘤电场治疗Optune Lua获批治疗..
  • 成本更低的实体瘤抗癌新星:CAR-..
  • 文献速递-子宫内膜癌中的卵黄囊..
  • Nature|MSCs首次用于人体跟腱病..
  • 推荐阅读 更多>>
  • 温州医科大学:研发具有监测眼压..
  • 温州医科大学:线粒体遗传代谢病..
  • 浙江大学《Cell》合作发文:新型..
  • 杭州师范大学:高度透明且可循环..
  • 基金专题

    我们提供最新鲜最全面的国自然、省自然、医院/学会基金相关资讯资料。
    • 相关阅读
    • 热门专题
    • 推荐期刊
    • 学院课程
    • 医药卫生
      期刊级别:国家级期刊
      发行周期:暂无数据
      出版地区:其他
      影响因子:暂无数据
    • 中华肿瘤
      期刊级别:北大核心期刊
      发行周期:月刊
      出版地区:北京
      影响因子:1.90
    • 中华医学
      期刊级别:CSCD核心期刊
      发行周期:周刊
      出版地区:北京
      影响因子:0.94