在过去的几年里，对患者肿瘤的全面分子分析在各种癌症中得到广泛研究，导致了一门新学科的发展，即“个性化”或“精准”医学。分子分析正在成为大多数晚期疾病患者的标准实践，有效补充了根据肿瘤的起源器官、组织学和分期制定标准化疗或治疗方案的历史治疗模式。这种方法使肿瘤学家能够重新组织他们对癌症的思考方式，并根据肿瘤发生的基因组驱动因素提出治疗建议。在某些情况下，这产生显著的积极结果，包括完全缓解，甚至在治疗难治性疾病的情况下，患者及其家属都感到高兴。

分子分析领域发展迅速，现在正将注意力从一些小的、预测性的、特定于疾病的、基于证据的“点菜”测试转移到更广泛的panel组合测试，以测量大量“基因或基因产物”的水平或变化。这些基因组变化可以作为治疗应答的预测生物标志物（表示肿瘤和患者的结果/对特定治疗的反应）和患者的预后（描述先天性肿瘤侵袭性，与患者的生存率一致，无论接受何种治疗）。越来越多的生物标志物被发现，其靶向药物正在被发现和开发用于临床治疗。科学进步与技术进步手牵着手，紧密相连，从而改善治疗选择。药物和伴随诊断都获得FDA批准，也引起医疗支付和医疗保险等关注。同时考虑到现在检测方法的局限性和区别为助力肿瘤治疗，区分胚系和体系变异尤为重要，如最新的胰腺癌BRCA胚系检测。

分子分析评估取样自患者肿瘤活检样本或血液循环的肿瘤细胞的DNA，RNA，蛋白。DNA水平的改变未必会导致生物学功能改变，所以有必要进行转录组和蛋白组水平的检测。大量数据的处理需要生物信息学分析处理与整合，帮助分析和释意生物学数据，选择出特定基因突变和特定治疗之间的关联。目前主要的检测技术如下：

DNA和RNA：PCR，ISH，FISH，CISH，NGS

蛋白质：IHC

MSI微卫星不稳定：MMR系统失活，高频移码突变，MMR基因如MLH1，MSH2，MSH6或PMS2胚系突变，导致遗传性林奇综合症。但80%为散发，主要因MLH1启动子区高甲基化状态所致。目前在高MSI在24种原发肿瘤发现，这类患者对IO治疗敏感。FDA批准默家的K药用于不可切活转移性的MSI－H或dMMR实体瘤。O药2017年FDA快速审批通道，2018获批12岁以上的MSI－H或dMMR的CRC。随后获批联合ipilimumab治疗这一人群。

这个原癌基因家族成员有NTRK1/NTRK2/ NTRK3，尽管在常见的肿瘤如NSCLC，CRC，头颈部肿瘤，甲状腺癌，膀胱癌等大概比例在1%，其在成人罕见肿瘤和儿童肿瘤常见。这三个基因NTRK1/NTRK2/ NTRK3分别编码TRKA，TRKB和TRKC，在视网膜母细胞瘤等瘤种活性升高，可以作为Larotrectinib精准治疗人群。Larotrectinib是口服高选择TRK抑制剂，2018年11月FDA批准用于儿童和成人不可切或转移的NTRK融合但是不存在已知耐药突变的实体瘤。这是继K药后的第二个基于基因组特征的泛瘤种药物。还有一个TRK抑制剂Entrectinib虽然在2017被FDA授予突破疗法但是目前尚未获批适应证。

基因突变可能是胚系或体系，胚系嘛，生下来就是遗传来了，体系主要是发生在肿瘤组织的，但是仅仅检测发现肿瘤样本存在突变也可能是胚系改变，所以还需要进一步取正常样本如血细胞或皮肤的DNA检测后确认下，常见的体系突变需要进一步胚系确认的基因变异如下表。

肿瘤篮子试验和精准医学

NCI-MATCH， ASCO-TAPUR，EORTC-SPECTA

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