1970-01-01
本文对于入组CA209-038研究的68名患者进行全外显子测序(WES)分析,入组患者接受Nivolumab治疗,之前接受或未接受过Ipilimumab进展。
- 之前接受(n=35)或未接受过(n=33)Ipilimumab进展的患者TMB平均表达183(1-7,360;interquartile range:44-433)两组之间无差异;
- 在未经Ipi治疗组发现TMB与克隆突变的表达和疗效呈正相关。在接受过Ipi治疗组则无此变化。这提示突变符合是未经前免疫治疗的Nivolumab治疗有效的预测因子;
- 突变标签在该研究中未发现与疗效相关。既往在NSCLC的研究中提示一些突变标签例如年龄、吸烟等和免疫治疗疗效相关,但在该黑色素瘤研究中,选择了一些常见标签例如UV、年龄等,未发现与疗效相关。
- 未发现有单个基因变化与治疗相应或有效呈显著相关。包括已知的与CTLA-4治疗相应相关的SERPINB3/B4突变,与杂合性缺失相关的B2M变化,与耐药相关的JAK1和JAK2变化。
- 在既往接受过Ipi治疗的患者中,基因不稳定频率的高低与Nivo治疗后OS相关,这一点在未经Ipi治疗的患者中并不存在。
- Nivo治疗前与治疗后突变表达的改变在有相应(CR/PR)和无响应(PD)的患者中显著不同。有相应的患者在治疗4周后会发现突变负荷与新抗原符合显著下降。
- 除了3名患者之外,所有CR/PR患者或陆续发现一个或多个突变的消失,而SD或PD的患者则会在治疗当中出现了新的突变。
- 对比CR/PR和PD患者,进行基因分类分析,和T细胞活性相关的基因(如IL17RE, IL17RC, FGFR3等)高表达的患者更能从中获益。比起之前未接受过Ipi治疗的患者更加多样化的免疫环境,在Ipi进展的队列尤为显著。
- 治疗T细胞克隆、基因克隆突变、新抗原比例也和疗效相关(CR/PR对比SD)。
- 我们假设发生相应的患者在治疗早期,大约4周左右会有分子层面的响应,发生了基因缩减的患者比持续患者获得更长的生存获益(OS,PFS)。包括PD-1信号通路,CD28共刺激因子家族,TCR下游通路,IFN-r,IL-2通路等富集。
- 和肿瘤生长相关的下游基因的变化,包括神经和黑色素通路、细胞周期、调控、有丝分裂和转译通路,我们可以观察到响应组比不响应组免疫反应基因上升。且CD8+ T细胞与NK细胞增多。
对于抗PD-1治疗相应发生应答的患者,研究者建立了一个模型,包括以下几点:
- 新抗原负荷:随着治疗的推进,新抗原突变减少,取得临床获益;
- 免疫细胞相关基因表达: 随着治疗的推进,免疫细胞相关基因表达增多,取得临床获益;
- T细胞变化:1. 之前进行过抗CTLA-4治疗的患者首先T细胞增多,取得临床获益。之后随着治疗进展,T细胞耗竭后肿瘤发生进展。再用PD-1之前的克隆重新活化,取得临床获益;2. 之前未进行过抗CTLA-4治疗的患者使用PD-1治疗后,T细胞克隆增多,取得临床获益。
免疫检查点抑制剂即将进入红海之争,而生物标志物的探索尚需进行,我们都知道PD-L1并非最佳Biomarker,TMB相当值得期待,这远不够,在分子层面进一步的探索相当重要。
老王的预测是,或许标记物是一组基因(而无需TMB,或许TMB中有的正向有的负向),或许是一组基因加一些细胞因子等于微环境相关的标记物,但是这个篮子究竟有多大,都装了哪些,还需要再探索呀。
Riaz et al., 2017, Cell 171, 934–949
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